Молекулярная биология презентация

Нуклеиновые кислоты

Розалинд Франклин
Rosalind Franklin
ДНК
1953 г. – Открытие структуры ДНК
1962 г. Фрэнсису Крику, Джеймсу Уотсону и Морису Уилкинсу была присуждена Нобелевская премия по физиологии и медицине

А – правозакрученная антипаралленная спираль, наблюдается в спиртовых растворах
В – основная конформация ДНК – правозакрученная антипараллельная, есть 2 броздки, основания перпендикулярны оси закрутки
Z – конформация – левозакрученная антипараллельная, образована чередованием
-TATATATATA- или
-GCGCGCGC-

Правило Чаргаффа:

Стабилизация за счет водородных связей

Нуклеосома
Гистоны
Компактизация ДНК

Метафазная хромосома
4
1 – центромера
2 – микротрубочки кинетохора
3 – плечи хромосом
4 - теломера
Вторичная перетяжка

Хроматин
Эухроматин
Гетерохроматин
Конститутивный
Факультативный
Плечи хромосом
Активная экспрессия генов
Плечи хромосом
Гены не экспрессируются
Центромера, теломеры хромосом, вторичные перетяжки
Нет генов, кодирующих белки

Энхансер (англ. enhancer) — небольшой участок ДНК, который после связывания с ним факторов транскрипции стимулирует транскрипцию с основных промоторов гена или группы генов.
Сайленсер (англ. silencer) — последовательность ДНК, с которой связываются белки-репрессоры (факторы транскрипции). Связывание белков-репрессоров с сайленсерами приводит к понижению или к полному подавлению синтеза РНК ферментом ДНК-зависимой РНК-полимеразой.
Инсуляторы — последовательности ДНК, особые регуляторные элементы, которые обладают способностью блокировать сигналы, исходящие от окружения.
гены
энхансер
инсулятор

Модификация гистонов
ацетилирование
деацетилирование
гетерохроматин
эухроматин
Ацетилирование – гены экспрессируются
Деацетилирование – гены «замолкают»
Метилирование – сайленсинг генов
N- концы «хвостов» гистонов – по ним идет модификация

Современное представление
центральной догмы молекулярной биологии
ДНК
РНК
Белок
транскрипция
трансляция
обратная
транскрипция
репликация
репликация
Репликация - воспроизведение и передача генетической информации в поколениях клеток и организмов
Транскрипция - это синтез всех видов РНК по матрице ДНК, осуществляемый ферментом ДНК-зависимой РНК-полимеразой
Трансляция - синтез полипептидной цепи рибосомой на РНК матрице из аминокислот
Центральная догма молекулярной биологии

ДНК-зависимая ДНК полимераза ε – синтез отстающей цепи, вырезает РНК праймеры перед собой
ДНК-зависимая ДНК полимераза δ – синтез лидирующей цепи
SSB белки – поддерживают однонитевое состояние
Хеликаза – расплетание цепи
Топоизомераза – убирает всверхспирализацию
Лигаза – сшивание однонитевого разрыва
Праймаза – прикрепление РНК праймера к отстающей цепи

ДНК-зависимая ДНК полимераза lll – синтез лидирующей цепи, фрагментов Оказаки отстающей цепи
ДНК-зависимая ДНК полимераза l – синтез отстающей цепи, вырезает РНК праймеры перед собой

Репликация у прокариот

Репликация у прокариот

Прокариоты
Другие полимеразы эукариот
Альфа – ДНК зависимая ДНК полимераза, сцеплена с праймазой, выполняет функции прокариотической полимеразы lll на отстающей цепи, не вырезает перед собой нуклеотиды
Гамма – митохондриальная ДНК зависимая ДНК полимераза
Бэта – для починки ДНК (одна из многих)

РНК
Ядрышко
Особый компартмент ядра, не отделенный мембраной
Синтез рРНК, сборка рибосомных субъединиц
Гены рРНК существуют во многих копиях, поэтому ядрышек обычно несколько

регуляторы
промотор
лидер
трейлер
кодирующая область - экзоны и интроны
Ген эукариот
Ген – участок ДНК, в котором закодирована информация о последовательности белка или структуре функциональной РНК + регулирующие элементы, необходимые для реализации информации

Транскрипция – ДНК зависимая РНК полимераза

Терминация. Сигналом для этого служит образование «шпильки» на РНК, при этом РНК отсоединяется от ДНК
РНК
Сигнал терминации
Самопроизвольное сворачивание
«шпилька»

Процессинг РНК
присоединение кэпа (7-метилгуанозина) к 5’ концу
полиаденилового хвоста к 3’ концу
вырезание интронов
сплайсинг (сшивание) экзонов

Сплайсинг
+ альтернативный сплайсинг

Генетический код
Триплетность
Избыточность 4*4*4=64>22
Однозначность
Универсальность одинаков для всех живых существ
Универсальность
Неперекрываемость отсутствие сдвига рамки считывания

Строение рибосомы

Рибосомы
Свободные в цитозоли
В виде полирибосом
Сидячие на ЭПР
Белки цитоплазмы, митохондрий, хлоропласт, пероксисом
Мембранные белки, белки на экспорт, в АГ, ядро, лизосомы, эндосомы

ДНК 3’----------5’ – матричная цепь
5’----------3’ – кодирующая цепь
РНК 5’----------3’
Белок NH2--------COOH
Инициация

Элонгация трансляции

Терминация

Белки

Белки

Первичная структура, образование пептидной связи

Вторичная структура – стабилизация за счет водородных связей

Альфа-спирали
Бета-слой белка

Третичная структура
Стабилизация:
Дисульфидные мостики –S-S- (цистеин)
Гидрофобные взаимодействия (аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин)
Водородные связи
Электростатика, диполь-дипольные взаимодействия

Другие классы соединений

Углеводы (гексозы)
Модель Фишера:
D-глюкоза в растворе:

D-глюкоза:
Бета-форма, линейная форма, альфа-форма

Лактоза
Сахароза
Олигосахариды
Мальтоза (две альфа глюкозы)

Полисахариды
Целлюлоза –
поли b-D глюкоза
Крахмал:
Амилоза (синий с KI) + Амилопектин (розовый с KI)
Гликоген – только амилопектин, но с большим числом ветвлений
Амилопектин - поли а-D глюкоза

Фосфолипиды

Фосфатидилсерин – в норме только во внутреннем слое мембраны, при появлении снаружи - апоптоз
Кардиолипин – мембраны бактерий и митохондрий

Цитология
эукариот
Избранные главы

Плазматическая мембрана

Органоиды эукариот
Немембранные
Рибосомы
Цитоскелет
Микротрубочки
Промежуточные филаменты
Актиновые филаменты
Клеточный центр
Одномембранные
Эндоплазматический ретикулум (ЭПР)
Гранулярный (грЭПР)
Гладкий (глЭПР)
Аппарат Гольджи
Лизосомы
Пероксисомы
Др.
Двумембранные
Ядро
Митохондрии
Пластиды

Цитоскелет эукариот. Микротрубочки
Полые трубки диаметром 25 нм с просветом 15 нм
Состоят из белка тубулина (димер альфа-тубулина и бета-тубулина)
С плюс-конца (ближе к периферии клетки) всё время идёт сборка, с минус-конца (ближе к центру клетки) – разборка
Сборка идет с затратами ГТФ
Функции
Поддержание формы клетки
Перемещение органоидов
Перемещение хромосом во время деления
Формирование жгутиков

Жгутик
Базальное тело = центриоль = кинетосома – 9х3 + 0
Переходная зона – 9х2 + 0
Аксонема = осевая нить – 9х2 + 2

Клеточный центр
Клеточный центр = главный центр организации микротрубочек (ЦОМТ).
У животных и многих протист содержит 2 центриоли, которые также служат базальными телами жгутиков. Центросома = 2 центриоли + окружение
У семенных растений, высших грибов, некоторых протист центриолей нет -> жгутики не развиваются. Но сам ЦОМТ есть

Микротрубочки и моторные белки
Моторные белки – транспорт органелл по микротрубочкам. Идёт с затратами АТФ
Динеины (от + к –, т. е. к центросоме)
Кинезины (от – к +, т. е. к периферии)
Динеины, закрепленные в аксонеме, обеспечивают движение жгутика, смещая микротрубочки в аксонеме друг относительно друга

Промежуточные филаменты
Канат из фиброзных белков
Диаметр 8-12 нм
Кератины и другие белки
Функции
Поддержание формы клетки и ядра
Заякоривание органелл
Формирование ядерной ламины
Участие в клеточных контактах (десмосомах)

Актиновые филаменты (микрофиламенты)
Две перекрученные цепочки глобулярного актина, реже – других белков
Имеются плюс- и минус-концы
Диаметр около 7 нм
Функции
Поддержание и изменение формы клетки
Образование ложноножек, амебоидное движение
Мышечное сокращение (вместе с филаментами миозина)

Хлоропласты

Хлоропласты
Образовались в результате эндосимбиоза эукариот с цианобактерией (сине-зеленой водорослью)
Содержат свою ДНК, рибосомы бактериального типа
Пиреноид – скопление фермента РуБисКО (фиксирует СО2), центр синтеза сахаров
Имеются в некоторых группах эукариот
Функции
Фотосинтез сахаров
Синтез нуклеотидов, аминокислот и др.

Хлоропласты в разных группах протист

Немного о митохондриях
Образовались в результате эндосимбиоза эукариот с альфа-протеобактрией
Содержат свою ДНК, рибосомы бактериального типа
Имеются почти у всех эукариот, если отсутствуют, то вторично
Функция – образование АТФ в ходе кислородного дыхания
Типы крист митохондрий
Пластинчатые, трубчатые, дисковидные

Вакуолярная система цитоплазмы
Плазматическая мембрана
Эндосомы
Лизосомы – разрушение, «переваривание»
Аппарат Гольджи - модификация (фосфорилирование, сборка четвертичных структур, др.) белков и сортировка белков
ГрЭПР – синтез и модификация белков, предназначенных для экспорта или встраивания в мембраны
ГлЭПР – синтез липидов
Ядро – фактически, его мембрана представляет собой продолжение ЭПР