Кладистика. Метод максимальной парсимонии. Метод присоединения соседей презентация

Август 1, 2022

Главная
Биология
Кладистика. Метод максимальной парсимонии. Метод присоединения соседей

Содержание

2. Метод максимальной парсимонии 1. Подсчёт числа эволюционных событий для каждого дерева 2. Выбор дерева с наименьшим
3. UPGMA Шаг 1. Составляем таблицу эволюционных расстояний: • принимаем каждое различие в признаках за 1
4. UPGMA
5. UPGMA
6. UPGMA
7. UPGMA
8. UPGMA
9. UPGMA
10. UPGMA
11. UPGMA
12. UPGMA
13. Метод присоединения соседей 1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q
14. Метод присоединения соседей 1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q
15. Метод присоединения соседей 1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q
16. Метод присоединения соседей 1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q
17. Метод присоединения соседей 1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q
18. Метод присоединения соседей 1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q
19. Метод присоединения соседей 1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q
20. Метод присоединения соседей 1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q
21. Метод присоединения соседей 1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q
23. Скачать презентацию

Слайд 2

Метод максимальной парсимонии
1. Подсчёт числа эволюционных событий для каждого дерева
2. Выбор дерева с

наименьшим числом таких событий

Слайд 3

UPGMA
Шаг 1. Составляем таблицу эволюционных расстояний: • принимаем каждое различие в признаках за 1

Слайд 4

UPGMA

Слайд 5

UPGMA

Слайд 6

UPGMA

Слайд 7

UPGMA

Слайд 8

UPGMA

Слайд 9

UPGMA

Слайд 10

UPGMA

Слайд 11

UPGMA

Слайд 12

UPGMA

Слайд 13

Метод присоединения соседей
1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q 4.

Присоединить 2 ветви с Qmin к узлу
5. Найти расстояние от данных ветвей до узла 6. Найти расстояние от остальных ветвей до узла
7. Построить новую матрицу расстояний (n-1)*(n-1)
…

Слайд 14

Метод присоединения соседей
1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q 4.

Присоединить 2 ветви с Qmin к узлу
5. Найти расстояние от данных ветвей до узла 6. Найти расстояние от остальных ветвей до узла
7. Построить новую матрицу расстояний (n-1)*(n-1)
…

Слайд 15

Метод присоединения соседей
1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q 4.

Присоединить 2 ветви с Qmin к узлу
5. Найти расстояние от данных ветвей до узла 6. Найти расстояние от остальных ветвей до узла
7. Построить новую матрицу расстояний (n-1)*(n-1)
…

Слайд 16

Метод присоединения соседей
1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q 4.

Присоединить 2 ветви с Qmin к узлу
5. Найти расстояние от данных ветвей до узла 6. Найти расстояние от остальных ветвей до узла
7. Построить новую матрицу расстояний (n-1)*(n-1)
…

Слайд 17

Метод присоединения соседей
1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q 4.

Присоединить 2 ветви с Qmin к узлу
5. Найти расстояние от данных ветвей до узла 6. Найти расстояние от остальных ветвей до узла
7. Построить новую матрицу расстояний (n-1)*(n-1)
…

Слайд 18

Метод присоединения соседей
1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q 4.

Присоединить 2 ветви с Qmin к узлу
5. Найти расстояние от данных ветвей до узла 6. Найти расстояние от остальных ветвей до узла
7. Построить новую матрицу расстояний (n-1)*(n-1)
…

Слайд 19

Метод присоединения соседей
1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q 4.

Присоединить 2 ветви с Qmin к узлу
5. Найти расстояние от данных ветвей до узла 6. Найти расстояние от остальных ветвей до узла
7. Построить новую матрицу расстояний (n-1)*(n-1)
…

Слайд 20

Метод присоединения соседей
1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q 4.

Присоединить 2 ветви с Qmin к узлу
5. Найти расстояние от данных ветвей до узла 6. Найти расстояние от остальных ветвей до узла
7. Построить новую матрицу расстояний (n-1)*(n-1)
…

Слайд 21

Метод присоединения соседей
1. Построить матрицу расстояний n*n 2. Построить Q-матрицу 3. Выбрать наименьшее значение Q 4.

Присоединить 2 ветви с Qmin к узлу
5. Найти расстояние от данных ветвей до узла 6. Найти расстояние от остальных ветвей до узла
7. Построить новую матрицу расстояний (n-1)*(n-1)
…