РК: каратауский архар, индийский дикобразз и каменная куница. Птицы содержит 118 видов. Из числа редких, ареал которых сокращается, и находятся под угрозой исчезновения 12 видов птиц занесены в Красную книгу Казахстана (1996 г.): белый аист, черный аист, змееяд, орел-карлик, степной орёл, беркут, бородач, Стервятник,балобан, красавка, джек, филин.
На сегодняшний день насекомых содержит более 152 вида, из числа редких насекомых 2 вида являются эндемиками Каратау и Средней Азии, 1 вид реликтовый, 8 занесены в Красную Книгу СССР (1984 г.) и Красную Книгу Казахстана.
Флора Каратауского хребта на всем протяжении содержит более 1 600 видов высших сосудистых растений.